Церковь возвели в 1853 году, о чем свидетельствует надпись на ее стене. Однако согласно некоторым документам, здание появилось в 1808 году. Во время Русско-турецкой войны в этом храме отпевали болгарских и русских солдат. Сегодня он является духовным центром армянской общины не только в Бургасе, но и во всем регионе. Сооружение попало в список культурных памятников в 1970 году.